Thermo Fisher Scientific在HUPO 2021会议上展示了其创新的蛋白质组学解决方案和一系列与行业专家的合作协议，旨在提高蛋白质组学工作流程的通量、全面性和质量，应用于单细胞研究和转化研究等。公司推出了新的色谱和质谱分析仪器，并与Biognosys等公司合作，提供高效准确的量化工具。此外，Thermo Fisher还推出了Vanquish Neo UHPLC系统，增强了蛋白质组学分析中的分离能力，并与Cellenion合作，提供单细胞蛋白质组学分析的完整工作流程。这些举措旨在使蛋白质组学工作流程更加高效和可重复，以满足不断增长的科研需求。
Thermo Fisher Scientific与Biognosys宣布继续合作，推进基于数据独立采集（DIA）质谱分析流程。双方共同开发了一套用于血浆基质中准确和灵活的无标记蛋白质定量和蛋白质组分析工作流程。新推出的Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480质谱仪和Orbitrap Exploris 240质谱仪，结合Biognosys PQ500试剂盒，实现了简化流程，提高了对血液样本分析的深度和灵敏度。此外，新型FAIMS DIA方法，借助Thermo Scientific FAIMS Pro接口，通过FAIMS技术对离子化物种进行分离，增强了选择性、重复性和蛋白质组覆盖范围。通过Biognosys PQ500试剂盒和Thermo Scientific SureQuant靶向检测套件，可以实现500种血浆蛋白的快速定量。这一单一工作流程有助于高效开发和应用靶向方法，通过定量蛋白质组学在转化和临床实验室中加速新发现的发现。Thermo Fisher Scientific将在vLC-MS.com虚拟活动和ASMS Reboot Program上展示合作成果和最新产品及软件解决方案。
Thermo Fisher Scientific与Biognosys续签合作协议，共同推进血浆定量分析在蛋白质组学中的应用。双方将利用Thermo Fisher Scientific的先进数据独立采集（DIA）质谱技术及Biognosys的PQ500血浆定量试剂盒，开发新型高效的分析方法——Thermo Scientific SureQuant PQ500方法，用于血浆及其他人体体液的定量分析。该方法支持Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480质谱仪和Thermo Scientific Orbitrap Eclipse Tribrid质谱仪。此外，双方还将应用基于质谱的BoxCar扫描方法进行非靶向、无标记定量分析，以提升血浆分析的动态范围。此次合作旨在提高临床样本分析的效率，为科学家提供先进的仪器方法和工作流程，以及新的软件功能，以快速、可靠地处理DIA工作流程产生的复杂数据集。
罗氏公司在其2019年MSACL会议上展示了一项模拟临床试验研究的数据，表明下一代发现蛋白质组学技术已准备好在临床试验中使用。这项研究由罗氏公司的Axel Ducret博士领导，Biognosys公司提供了数据支持，该公司是一家瑞士蛋白质组学公司。研究使用了30个FFPE结直肠癌肿瘤样本，通过靶向和发现蛋白质组学策略进行了分析。Biognosys使用下一代数据独立获取技术生成了数据，这是一种无标记的质谱方法，结合了并行获取肽特征和靶向数据分析。研究识别了近9000种蛋白质，其技术变异系数（CV）中值低于10%，为检测肿瘤组织中蛋白质表达的微妙变化提供了足够的统计能力。Biognosys首席运营官Claudia Escher表示，公司正致力于将发现蛋白质组学技术整合到临床试验中。这项研究为建立符合GCP指南的发现蛋白质组学管道奠定了基础，并可用于支持更有效和高效的临床试验设计。
AI基因组学公司Freenome与领先蛋白质组学公司Biognosys宣布合作，旨在通过解码细胞游离（cf）生物标志物模式，提升早期癌症检测和精准肿瘤学的广泛信号方法。Freenome的AI基因组学平台旨在通过分析血液中肿瘤DNA（ctDNA）的循环片段，以及免疫和其他细胞在肿瘤环境中被破坏时释放到血液中的cfDNA和cfRNA片段，来检测癌症的早期阶段。与Biognosys的合作将增强Freenome的多分析、广泛信号方法，通过添加对数百种蛋白质和数千种肽的深度和精确的蛋白质定量，以开发其首个商业可用筛查测试。该合作有望改善测试性能，并吸引学术机构和大型制药公司对癌症及其他疾病治疗的研究兴趣。
Thermo Fisher Scientific与Biognosys达成合作，共同推广适用于数据无关获取（DIA）研究的综合高效工作流程，通过结合使用Orbitrap质谱仪和Spectronaut Pulsar软件，实现库创建和数据处理。该方案兼容Thermo Scientific Q Exactive HF-X混合四极杆Orbitrap质谱仪及之前的Orbitrap仪器，允许研究人员进行数据无关分析，实现单次运行中对数千种蛋白质的重复性和准确性定量。DIA方法可全面记录样本所有成分的谱图特征，与高分辨率Orbitrap仪器结合，成为全球表达谱分析的通用方法。Spectronaut Pulsar软件能够高效创建光谱库并处理大型DIA数据集。双方将继续优化DIA相关工作流程，并在ASMS会议展示相关软件和仪器。
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