洞察市场格局
解锁药品研发情报

客服电话

400-9696-311
医药数据查询

Genome Biol丨中国药科大学徐澍等团队合作开发了一种新型RNA切割工具:TaqTth-hpRNA

RNA切割



致病性等位基因沉默是一种很有前途的治疗遗传性遗传病的方法。


2024年7月7日,中国药科大学徐澍、郭永健及司马健共同通讯在Genome Biology在线发表题为TaqTth-hpRNA: a novel compact RNA-targeting tool for specific silencing of pathogenic mRNA的研究论文,该研究开发了一种RNA切割工具:TaqTth-hpRNA,由一个小的嵌合TaqTth和一个发夹RNA引导探针组成。


体外和体内研究表明,TaqTth-hpRNA具有最小的侧翼序列基序要求,可以有效和特异性地切割RNA。阿尔茨海默病模型中,证明了在不改变野生型APP mRNA的情况下沉默突变APPswe mRNA。值得注意的是,由于TaqTth的紧凑大小,能够在单个AAV载体中与APOE2过表达结合,从而产生更强的病理抑制作用。


多种RNA靶向策略的发现使高效的RNA编辑、RNA病毒抑制、核酸检测,当然还有基因治疗成为可能。基因治疗,特别是通过转录后RNA敲低介导的基因治疗,有可能成为治疗由致病性突变引起的疾病的理想方法。例如,在家族性阿尔茨海默病(FAD)中,致病性APP瑞典突变(APPswe)的等位基因特异性沉默导致过量的Aβ产生,是治疗FAD的一个有价值的武器。然而,考虑到野生型APP在中枢神经系统发育中起着至关重要的生理作用,野生型APP数量的脱靶改变(与突变致病APP在编码序列上只有一两个碱基差异)可能会加重AD症状。因此,应该探索更多的高特异性RNA敲低工具来区分靶标上的最小碱基差异。    
以前,报道过皮瓣内切酶1(FEN1)可以通过DNA探针而不是RNA探针来切割目标RNA。虽然可以区分目标底物“种子区”的单碱基差异,但效率有待进一步提高。与此同时,各种鲁棒性的RNA切割CRISPR效应物被开发出来,它们具有RNA引导的共同特征。虽然sgRNA作为质粒或PCR产物的DNA类型被转染到细胞中,但大量的转录产生是CRISPR系统高效的重要原因。与丰富的sgRNA相比,DNA探针在细胞核中自由扩散的数量是有限的。这启发在RNA探针的引导下探索高特异性RNA核酸酶。
TaqTth-hpRNA的设计和凝胶实验中的验证(图源自Genome Biology 
据报道,水热菌和嗜热菌DNA聚合酶(分别简称为TaqPol和TthPol)具有RNA依赖的5'核酸酶活性。此外,聚合酶家族包含与FEN1非常相似的功能域,推断聚合酶也可能像FEN1一样对靶底物的错配敏感。它也可能具有最小序列基序要求的优势,如fen1相关系统。因此,推测聚合酶可以识别RNA探针,并可以进一步设计为高效的RNA切割工具。    
在这项研究中,新的RNA切割工具将在体外和体内进行构建和测试,包括效率、特异性、序列-基序要求和细胞毒性。然后,将应用它来证明对APPswe突变的强敲除,避免改变野生型APP mRNA。考虑到TaqTth的紧凑大小,将尝试将其与人载脂蛋白E2(APOE2)过表达编码在单一AAV载体中结合,以抑制小鼠模型的病理变化。因此,相信这个新的工具包,作为现有系统的替代方案,可能有潜力为基因治疗策略提供宝贵的工具。



TaqTth的大小紧凑,能在单个AAV载体中与APOE2过表达结合从而产生更强的病理抑制作用。派真生物一站式CRO&CDMO服务平台,可提供全面的病毒载体包装服务和个性化定制服务。我们的产品线涵盖腺相关病毒(AAV)载体慢病毒载体、mRNA服务,为您的遗传性遗传病基因治疗研究提供全方位的支持,欢迎后台留言咨询详情。


转自:iNature

关于派真生物


<END>
*版权声明:本网站所转载的文章,均来自互联网,旨在传递更多信息。鉴于互联网的开放性和文章创作的复杂性,我们无法保证所转载的所有文章均已获得原作者的明确授权。如果您是原作者或拥有相关权益,请与我们联系,我们将立即删除未经授权的文章。本网站转载文章仅为方便读者查阅和了解相关信息,并不代表我们认同其观点和内容。读者应自行判断和鉴别转载文章的真实性、合法性和有效性。
AI+生命科学全产业链智能数据平台

收藏

发表评论
评论区(0
  • 暂无评论

    摩熵医药企业版
    50亿+条医药数据随时查
    7天免费试用
    摩熵数科开放平台
    原料药
    十五五战略规划

    全球新药治疗领域统计

    全球新药靶点统计

    专利数据服务
    添加收藏
      新建收藏夹
      取消
      确认