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广州健康院王杰课题组开发跨物种单细胞组学数据分析的新工具CACIMAR

生物谷生物谷
2024/07/19
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435
单细胞组学

近日， 中国科学院广州生物医药与健康研究院王杰课题组 开发了新的计算工具 CACIMAR （Cross-species Analysis of Cell Identities, Markers, Regulations）， 用于分析跨物种单细胞转录组测序数据（scRNA-seq），揭示物种间细胞类型、标志基因、细胞内调控以及细胞间相互作用的进化保守性。 物种不仅在基因层面，也在细胞类型、基因表达、基因调控、细胞间相互作用等方面显示出进化保守性。 单细胞转录组测序技术已广泛用于不同物种的单细胞表达研究，为在细胞类型水平研究物种的进化保守性提供了新机会。

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