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长达231nt,编辑效率经验证!金斯瑞pegRNA助力Prime Editor实现更安全高效的基因编辑

2024/09/02
逆转录酶 金斯瑞 Prime Editor


Prime Editor(先导编辑器)具有无双链断裂可降低脱靶效应、无需基因敲入模板更简单的优势,可以用于进行目标基因序列的删除、替换和插入,支持基因与细胞疗法开发、动物与细胞模型构建、基因突变与功能研究等应用。


2024年4月, FDA批准了Prime Medicine的PM359疗法IND申请,这是全球首个获批的先导编辑技术疗法,用于治疗慢性肉芽肿性疾病(CGD),为开发更安全高效的基因编辑疗法开辟了新思路。


长达231nt的pegRNA!

赋能Prime Editor实现无限可能


Prime Editor由Nickase Cas9-逆转录酶和pegRNA构成,Cas9-逆转录酶会在pegRNA的引导下,精准地切开目标DNA单链,根据逆转录模板,合成含有正确序列的DNA,完成基因编辑。


其中,pegRNA长度一般在110nt以上,pegRNA组成与功能如下:

  • 引导序列(Spacer):特异性结合至目标序列

  • 骨架序列(Scaffold):固定序列,与Nickase Cas9结合

  • 逆转录模板(RTT):包含编辑序列信息

  • 逆转录引物结合位点(PBS):开启逆转录反应

  • 3端修饰motif(可选):可添加3’tevopreQ1 motif等修饰,防止3端序列被降解,提升编辑效率


金斯瑞深耕寡核苷酸合成22年+,可提供长达231 nt的全化学合成长链RNA,稳定的质量和优越的编辑效率获得国内外客户的高度认可。


金斯瑞pegRNA服务优势:

  • pegRNA长达231 nt!支持脱盐和HPLC级别,分子量精准,纯度高,批次间一致性好

  • 编辑效率高超过60%!提供默认修饰或定制3’端修饰motif提升编辑效率

  • 一站式解决方案!提供PE2/PE3 mRNA、nicking sgRNA、经实验验证的操作指南

  • RUO至GMP级别的产品!全程支持您的项目从研发阶段走向临床研究和IND申报


金斯瑞pegRNA服务详情:

  • 合成长度:110-231 nt

  • 默认修饰:默认修饰更稳定,常规硫代、2'-甲氧基修饰不额外收费

  • 纯化方式:脱盐或HPLC

  • 交付规格:2-100nmol 干粉(默认),TE buffer / Nuclease-free water(可选)

  • 交付报告:脱盐-MS和COA报告,HPLC纯化-MS、HPLC报告(纯度≥85%)、COA报告

  • 生产周期:7个工作日起


经实验验证!

pegRNA编辑效率高,细胞毒性低


金斯瑞脱盐和HPLC纯化级别的sgRNA均经实验验证,分子量精准、纯度高、编辑效率高达63%,可保证Prime Editing实验顺利获得理想的结果。


案例1. 长达231 nt!分子量精准,纯度高达97%


左右滑动查看更多数据


案例2.  pegRNA 编辑效率高达63.5%



实验方法:

  • HEK293T cells (0.2 x 106个细胞) ,靶向HEK3位点,敲除5bp碱基

  • 以3:1的比例电转脱盐或HPLC纯化的pegRNA (141nt) 和nicking sgRNA,加入0.15μg、0.25μg、0.375μg、0.5μg、0.75μg、1.0μg的PE2/PE3 mRNA

  • 3天后提取基因组DNA,通过Sanger测序检测基因编辑效率


实验结果:

  • HPLC 纯化pegRNA编辑效率高达63.5%,脱盐pegRNA编辑效率高达52.5%


案例3. 添加3'tevopreQ1 motif,编辑效率提升40%


左右滑动查看更多数据


实验方法:

  • HEK293T cells (0.2 x 106个细胞) ,靶向HEK3位点

  • 电转1μg PE2/PE3 mRNA, 30pmol nicking sgRNA和90pmo不同长度的pegRNA (HPLC纯化)

  • 3天后提取基因组DNA,通过Sanger测序检测基因编辑效率


实验结果:

  • pegRNA的编辑效率可能随pegRNA增长而降低

  • 添加 3'tevopreQ1 motif的pegRNA编辑效率可高达43.4%,远高于不加该结构的pegRNA(仅3.2%)


案例4. 脱盐与HPLC pegRNA细胞毒性低



实验方法:

  • HEK293T 细胞 (0.2 x 106个细胞) ,靶向HEK3位点

  • 以3:1的比例加入脱盐或HPLC纯化的pegRNA (141nt) 和nicking sgRNA,同时分别加入0.5μg、0.75μg、1.0μg的PE2/PE3 mRNA

  • 3天后,检测细胞毒性,相对细胞活性% = pegRNA加样组细胞数量 / 空白组细胞数量


实验结果:

  • 脱盐或HPLC纯化的pegRNA在45 pmol,67.5 pmol,90 pmol的浓度下对HEK293T细胞无明显细胞毒性


基于金斯瑞强大的长链RNA合成能力,我们不仅可以交付更长的pegRNA支持更多样化的编辑方案,也可以添加3端motif修饰,获得更高的编辑效率,助力Prime Editing实验高效开展,探索无限可能。


欢迎咨询金斯瑞pegRNA合成服务,专业技术支持为您服务:

邮件:oligo@genscript.com.cn

电话:400-025-8686转5812或5815


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