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arXiv2024|基于蛋白质语言模型的序列设计强化学习

2024/09/17
蛋白质语言

论文的核心思想是通过使用PLMs对序列进行评分,使用RL方法生成具有生物学意义和结构多样性的蛋白质序列。 PLMs作为奖励函数: 论文提出了使用大型PLMs模型(如ESMFold)来作为RL的奖励函数,为生成的蛋白质序列进行生物学可行性评分(如TM-score)。 ESM-PF代理模型 :为了降低计算成本,作者提出了ESM with Proxy-Finetuning (ESM-PF) 方法,通过一个较小的代理模型来代替ESMFold进行评分。

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