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【Chemical Science】浙江大学侯廷军等：基于片段的分子生成模型FragGen

精准药物精准药物
2024/10/27
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538
分子生成

基于三维结构的分子生成是生成式人工智能在药物发现中的成功应用之一。 早期出现的基于原子的分子生成模型如 LiGAN 、 Pkt2Mol 、 DiffBP 和 ResGen 等，输出的分子通常具有较好的对接分数，但同时也普遍存在两个问题：一是生成的分子构象经常出现扭曲或偏离口袋（图- 1 GraphBP 和 DiffBP ）；二是倾向于生成大的并环结构来填充口袋（图- 1PktMol 和 ResGen ）。 虽然这样的结构可能会与靶蛋白产生更强的相互作用，但是复杂的结构往往不利于合成且易导致毒性。

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