2026年10月下旬,中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞团队三项工作相继发表:10月28日在 Nature Plants在线发表研究论文,建立面向双子叶作物的引导编辑系统 SmartPE;10月20日在 Trends in Biotechnology 在线发表特邀综述,梳理从基因组编辑走向染色体工程的技术版图;10月28日与英国塞恩斯伯里实验室合作在Cell 发表评论文章,讨论育种创新产品的安全性与监管错位。三项工作从不同层面回答同一个问题:植物基因组能被设计到什么程度。
引导编辑能在不断裂DNA双链、不引入供体模板的条件下完成碱基替换和小片段插入删除,但在双子叶植物中效率一直偏低。团队推测,在dual-PE策略中逆转录模板与基因组DNA互补配对可能干扰逆转录,且细胞错配修复途径会抑制引导编辑发生,于是在两条pegRNA的模板中同时引入互补错配,结果显示靶点平均编辑活性提高6倍以上,这一策略即SmartPE。在此基础上,团队在启动子与Cas9编码序列之间插入顺式调控元件,提高编辑器转录水平;并结合筛选到的高效逆转录酶变体,进一步提高了SmartPE的效率。经测试,在番茄、大豆、油菜原生质体中,常规策略下几乎没有活性的多个靶点取得了5%—10%的编辑效率。
SmartPE解决的是单点编辑的效率,综述把视线放到更大的尺度。大尺度DNA的靶向精准删除、插入、替换、重复、倒位与易位,是植物生物技术长期未解的难题;综述按驱动DNA重排的机制,把大片段编辑分为双链断裂依赖编辑、引导编辑、重组酶介导编辑和转座酶介导编辑四类,并归纳了重编程基因表达、核型工程等应用方向。文章还讨论了人工智能在大片段编辑技术中的作用:从编辑酶挖掘改造、转座系统从头设计到供体模板优化,AI大幅缩小了“设计—构建—测试—学习”循环的筛选范围;但植物领域仍缺少针对植物基因组的编辑结果预测模型,高质量数据集是下一步推进AI介入的基础。
第三篇讨论育种创新与监管挑战。文章指出,现行监管多以育种方法为判断依据,而不是关注最终产品的性状和潜在风险,各地监管规则不一致,导致一批风险较低的创新成果难以进入实际应用。以玉米为例:将7个玉米自身来源的抗病基因定点整合到同一位点,可同时抵抗4种主要病害。该产品不含外源物种来源的DNA序列,具有与传统育种产品相似的遗传特征,已获得美国农业部的豁免监管认定,但在其他国家和地区仍面临监管不确定性。作者主张建立以科学为依据、与风险相称、以产品特征为导向、全球协调一致的监管框架。
三篇文章落点不同,但指向的发展趋势一致:植物研究正从“基因组编辑”向“染色体工程”拓展,目标是实现植物基因组的理性设计。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41477-026-02447-w
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S016777992600418X?via%3Dihub
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867426011207?via%3Dihub

SmartPE系统提高双子叶植物引导编辑效率

植物大片段基因组工程的未来方向
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