此外，在实验室染色、氧化还原指示、抗疟研究、神经科学研究等领域也扮演着关键角色。 亚甲基蓝有毒，存在特定的严重风险（尤其是对G6PD缺乏症患者和与某些药物的相互作用），因此必须在医生指导下使用。 研究人员在进行的体外研究中发现，亚甲基蓝（Methylene Blue ）对乙肝表面抗原（HBsAg ）有一定的作用，使其具有作为一款慢性乙型肝炎新治疗药物的潜力。
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