ACADIA Pharmaceuticals Inc. 与 Sepracor Inc. 的合作在2005年1月成立，Sepracor 完成了对 ACADIA 第二次共1000万美元的股票购买，每股价格为12.29美元，较合作一周年前30日平均收盘价溢价25%。此举使得Sepracor持有ACADIA共计813,393股普通股。双方合作旨在开发针对中枢神经系统疾病的创新药物，包括针对精神分裂症和其他神经精神疾病的m1激动剂研究，以及将ACADIA的5-HT2A程序中的前体化合物与Sepracor的失眠药物LUNESTA结合使用。Sepracor将为ACADIA提供三年期的研发资金，并在满足特定条件时支付里程碑付款和全球产品销售提成。如果合作成功开发出单一产品，Sepracor将向ACADIA支付高达4000万美元的款项。ACADIA专注于中枢神经系统疾病的治疗，目前拥有多个临床和临床前药物项目。Sepracor则专注于治疗和预防人类疾病，其产品线集中于呼吸和神经系统疾病。

Organon，阿克苏诺贝尔公司的人类健康护理业务部门，与Sareum Holdings plc，一家专注于基于结构的药物发现和服务业务，于2006年1月17日在荷兰Oss和英国剑桥宣布了一项合作研究协议。该合作旨在生成针对自身免疫性疾病如类风湿性关节炎的潜在新疗法的先导化合物系列。Sareum将致力于确定Organon的两个自身免疫性疾病蛋白靶点的三维结构，并利用其创新的模板筛选方法，通过其自动药物化学平台识别适合优化为候选药物的全新化合物。Sareum将获得研究费用和成功里程碑付款，但具体财务细节未公开。这是Sareum在2006年1月5日发布的交易更新中宣布的第二个合作，当时Sareum表示，在12月底已进入多项合作，其中之一就是与Organon的合作。Sareum首席执行官Tim Mitchell博士表示，Organon选择Sareum作为其药物先导识别和优化的合作伙伴，这是迄今为止签订的最大合作，结合了他们在蛋白质结构确定、模板筛选和自动化学方面的专业知识。Organon国际公司全球研究执行副总裁David Nicholson博士补充说，与Sareum的合作非常适合其扩大研究项目广度和深度的目标，通

ChemGenex Pharmaceuticals与德国默克集团签署了为期三年的新合作协议，旨在为糖尿病、胰岛素抵抗及其并发症领域提供临床前支持，直至2008年12月31日。根据协议，ChemGenex将获得约100万澳元的总保留费用，并可能根据提供的临床前支持的数量和类型获得额外支付。这一新协议是在成功完成三个目标发现研究合同之后达成的，反映了默克集团与ChemGenex之间持续紧密的合作关系。ChemGenex首席执行官Greg Collier博士表示，新协议标志着ChemGenex的一个重要阶段，并相信将出现围绕公司几个专有目标的新合作伙伴机会。默克KGaA的执行副总裁Inge Lues博士表示，新协议为默克提供了进入糖尿病研究独特能力的途径，并希望保持对这些能力的访问，以用于多个有趣的小分子治疗药物的临床前开发。ChemGenex是一家致力于通过基因组学进行目标发现和验证，并在临床试验中开发更个性化的治疗效果，以改善患者生活的制药开发公司。

BioFocus，Galapagos的服务部门，于2006年1月16日在比利时梅赫伦宣布与Boehringer Ingelheim在自身免疫发现研究领域开展为期三年的新合作。根据协议，BioFocus将扩大其SilenceSelect si-RNA基因库，开发针对自身免疫疾病的专用细胞检测方法，并利用该方法进行靶点发现筛选。Galapagos将获得预付款、研发资金，并在满足特定药物发现标准时可能获得里程碑式费用。如果所有靶点标准均达成，Galapagos的总合同价值可能超过200万欧元。此次合作利用了Galapagos在自身免疫领域的专业知识及其靶点发现平台的优势，Galapagos致力于提供新的药物靶点，以开发针对自身免疫疾病未满足的医疗需求的新疗法。

Clinical Data公司宣布与匹兹堡大学癌症研究所（UPCI）达成一项合作研究协议，旨在通过代谢组学分析血清样本来研究肺癌患者和对照者的生物化学特征。这项研究旨在探索代谢组学在癌症检测和筛选中的应用潜力，并可能为商业化和药物开发提供新的见解。匹兹堡大学的William L. Bigbee博士将担任首席研究员，而Clinical Data的Thomas Colatsky博士也将参与研究。双方将共同拥有研究成果的发布和传播权。

阿斯利康与德克萨斯大学MD安德森癌症中心达成科学合作协议，旨在共同进行针对肺癌、头颈癌和结直肠癌等呼吸道消化系统癌症的新治疗方案研究。这些可续签的三年合作协议将促进双方在阿斯利康肿瘤产品和研究项目上的多种合作，通过整合临床前和临床研究提高效率。双方共同目标是设计更高效的临床试验，以快速确定创新癌症治疗方法的疗效。阿斯利康拥有多种新型癌症药物，包括小分子和单克隆抗体，MD安德森癌症中心则以多学科患者护理和转化研究著称，双方合作有望加速新治疗方法的开发。

Vertex Pharmaceuticals与Cystic Fibrosis Foundation Therapeutics（CFFT）宣布延长其研究合作，CFFT将额外提供2200万美元支持Vertex研发治疗囊性纤维化（CF）的“corrector”化合物。这些化合物旨在恢复CFTR蛋白的功能，该蛋白是导致CF的细胞膜蛋白。Vertex的CF研究已取得进展，包括“potentiator”和“corrector”两种治疗途径。CFFT与Vertex的合作历史长久且成果丰硕，双方期待发现新的治疗方法，为成千上万的CF患者提供新的治疗选择。Vertex的CF研究始于2000年，CFFT将提供约2200万美元的额外合同支付，用于corrector研究，Vertex保留开发并商业化发现化合物的权利，并将支付CFFT净销售额的版税。

Supernus Pharmaceuticals，一家新成立的专科制药公司，宣布收购Shire Laboratories Inc.（SLI）的产品配方和开发业务的大部分资产，SLI是Shire plc的子公司。该公司由前SLI总裁兼CEO杰克·A·卡塔尔创立，由New Enterprise Associates（NEA）和OrbiMed Advisors资助。Supernus专注于开发自有产品组合以及与其他制药公司的合作产品，利用其专利技术和产品开发能力。此次收购基于SLI在开发Adderall XR、Carbatrol、Equetro和Oracea等先进产品方面的成功和记录。NEA和OrbiMed Advisors均表示对与Supernus合作并共同发展其成为成功的专科制药公司感到高兴。Supernus拥有完整的研发和生产能力，将致力于开发针对特定专科治疗领域的产品。

Mylan Laboratories Inc. 与 Forest Laboratories Holdings, Ltd. 达成协议，共同商业化、开发和分销Mylan的创新型β受体阻滞剂nebivolol，在美国和加拿大市场进行。Forest将向Mylan支付7500万美元的预付款及可能的未来里程碑付款，并承担所有nebivolol的开发费用。Forest将负责所有销售和营销费用，Mylan保留未来共同推广产品的选择权。Mylan已于2005年5月31日收到美国食品药品监督管理局（FDA）对nebivolol新药申请的批准信，但最终批准取决于满足FDA的额外要求。Mylan计划在2006年下半年提交另一份nebivolol新药申请，用于治疗充血性心力衰竭。Nebivolol已在北美以外的65多个国家获得批准和销售。Mylan于2001年从Janssen Pharmaceutica N.V.获得了nebivolol在美国和加拿大的权利，并已获得Janssen的同意，将这些权利转授给Forest Laboratories。

Ablynx公司与Centocor Research and Development签署了合作研发协议，共同研究基于Nanobodies™的新型治疗药物递送方法。Nanobodies™是一种新型治疗蛋白，结合了传统抗体和小分子药物的有益特性，具有传统抗体的亲和力和选择性，但体积更小。Ablynx公司致力于开发Nanobodies™治疗各种严重和威胁生命的疾病，目前已有多个治疗项目处于临床前研究阶段。此次合作将结合Ablynx在Nanobody™平台上的专长和Centocor在治疗抗体开发方面的世界级专业知识，为Ablynx创造独特的发展机遇。