ChiCTR2600126504
尚未开始
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2026-06-10
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结直肠恶性肿瘤
深度学习与先进光学成像技术的巧妙融合：全尺度三维空间转录组学
深度学习与先进光学成像技术的巧妙融合：全尺度三维空间转录组学
本研究提出将深度学习算法与双光子荧光成像技术相结合的创新方案，旨在突破传统空间转录组学的局限，实现三维空间转录信息的获取。具体而言，我们充分发挥深度学习的独特优势，对双光子荧光成像技术生成的复杂数据进行分析与解读。通过在空间转录组学和成像数据的大型数据集上训练深度学习模型，我们能够提取出其他方法难以辨识的有意义特征和模式。这使得我们能够以高精度重建组织内基因表达的三维空间分布。除了实现三维空间转录信息采集外，本研究还通过建立一种在细胞、组织和活体水平获取全尺度空间转录信息的方法，为该领域做出了创新性贡献。这一突破得益于跨尺度光学信息的一致性，使我们能够弥合不同生物组织层次间的知识鸿沟。通过整合多尺度数据，我们得以更全面地理解基因表达的空间调控机制及其对疾病发展和治疗的潜在影响。总体而言，本研究填补了空间转录组学领域的重要技术空白，为探究疾病成因和治疗策略提供了新型快速诊断方法。该方法有望显著提升我们对各类疾病分子机制的理解，并推动个性化医疗的发展。
横断面
其它
无
无
自筹
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61
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2025-06-01
2026-12-30
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1.诊断与来源：经病理证实为结直肠癌，拟行根治性或姑息性手术切除； 2.样本可获得性与质量要求：能够在规定时间窗口内完成组织处理；组织量满足双光子成像与空间转录组检测的最低需求。 3.临床资料完整性：可获取核心临床病理信息：年龄、性别、肿瘤部位（结肠/直肠、左右半结肠）、TNM分期、分化程度、是否存在淋巴/血管/神经侵犯、治疗信息（是否新辅助治疗等）。 4.知情同意：受试者本人或法定代理人签署组织样本采集与科研使用的书面知情同意书（含基因检测/转录组检测相关条款，若适用）。 1.诊断与来源：经病理证实为结直肠癌，拟行根治性或姑息性手术切除；2.样本可获得性与质量要求：能够在规定时间窗口内完成组织处理；组织量满足双光子成像与空间转录组检测的最低需求。3.临床资料完整性：可获取核心临床病理信息：年龄、性别、肿瘤部位（结肠/直肠、左右半结肠）、TNM分期、分化程度、是否存在淋巴/血管/神经侵犯、治疗信息（是否新辅助治疗等）。4.知情同意：受试者本人或法定代理人签署组织样本采集与科研使用的书面知情同意书（含基因检测/转录组检测相关条款，若适用）。；
请登录查看1.病理类型不符合主要队列：术后病理提示为非腺癌为主的类型（如神经内分泌肿瘤、淋巴瘤、GIST、鳞癌等）且研究方案未预设纳入者。 2.治疗因素导致转录组/组织结构显著改变且不适合主要分析:术前接受新辅助放化疗、免疫治疗或靶向治疗，导致组织坏死比例高、肿瘤残存极少或RNA质量明显受损者。 3.样本质量不达标 (1)组织离体后处理超出SOP规定时间，或固定/冷冻/保存条件不符合要求； (2)组织严重自溶/机械挤压/电凝灼伤，无法满足双光子成像或空间转录组检测； (3)RNA质量或测序/建库质控不合格（如RIN/ DV200/空间转录平台质控指标未达标——你可用“按平台质控标准判定”表述，避免写死数值）； (4)成像数据严重伪影、信噪比不足或无法完成跨模态配准（如切片折叠、脱片、强背景荧光等），且无法重采。 4.样本代表性不足 ： (1)仅能获得极少量组织，无法同时满足（或至少满足其一）双光子成像与空间转录组检测最低需求； (2)肿瘤组织中肿瘤细胞含量过低（例如几乎全为坏死/炎症渗出），经病理评估不具备分析意义。 5.合并其他肿瘤或特殊情形影响解释 ： (1)合并其他活动性恶性肿瘤（除非为治愈后稳定期且方案允许）； (2)明确遗传综合征相关肿瘤（如Lynch、FAP）若你不计划纳入（可写“未预设分层者排除”；若计划纳入，应改为记录并分层）。；
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