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专家点评Nat Biotechnol | 王宇团队报道CRISmers+GRAPE-LM RNA适配体进化新范式

核酸适配体 (aptamer) 由诺奖得主Jack Szostak命名,是一类短的单链DNA (ssDNA) 或RNA寡核苷酸,能够折叠形成特定三维结构,并以“结构分子”的方式高亲和力结合蛋白或小分子,从而具备开发成为核酸药物和诊断探针的潜力 【 1,2 】 。 然而,适配体发现长期依赖指数富集的配体系统进化技术 (SELEX) ,通常需要多轮、强人工参与的筛选与优化;更关键的是,在体外简化条件下获得的适配体,亲和力和特异性常常不高,限制了其开发成核酸药物和探针的潜力 【 3 】 。 王宇课题组在既往工作中提出CRISmers (CRISPR/Cas-based aptamers screening system) ,将适配体筛选从溶液和细胞表面体系推进到细胞内环境,使筛选过程天然包含内源生物学机制,体现了内源折叠构象、相互作用特异性、充分的分子竞争等关键变量,从源头提升生物学相关性 【 4,5 】 。
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