亮点 | 正序生物科学创始人在Cell发表关于基因组扩增编辑新工具的文章

正序生物

2024/06/28

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心血管疾病恶性肿瘤肿瘤上海科技大学 CS-101注射液

► 开发了一种名为“Amplification Editing（AE）”的基因组扩增编辑新工具，以可编程的方式精确高效地复制从小片段到染色体级别的基因组序列。

► 该工具的开发可促进基因组疾病模型的建立，推动基因进化和癌症机制相关的研究。

2024年6月26日，国际学术期刊Cell杂志在线发表了正序生物科学创始人、武汉大学医学研究院、中南医院医学研究院、教育部免疫与代谢前沿科学中心、泰康生命医学中心殷昊教授科研团队的研究成果“Amplification editing enables efficient and precise duplication of DNA from short sequence to megabase and chromosomal scale”，开发了一种名为“Amplification Editing（AE）”的基因组编辑工具，可实现从短片段到染色体长度的精准复制。该工具的开发可促进基因组疾病模型的建立，推动基因进化和癌症机制相关的研究。

▲ Cell发文

基因扩增（基因重复）是指在生物体内复制DNA片段，形成重复序列。扩增范围从几个碱基对到染色体大部分区域。基因扩增是一种染色体的结构变异，在进化、遗传性疾病和癌症的发生发展中扮演重要角色。现有的基因编辑工具能做到单个位点的精准编辑，但是缺乏高效精确的基因组结构编辑工具。

正序生物科学创始人殷昊教授专注于细胞和基因治疗领域，其科研团队开发了一种高效精准的基因组结构编辑工具“Amplification Editing（AE）”，突破了现有基因编辑工具单个基因位点编辑的局限，以可编程的方式精确高效地复制从小片段到染色体级别的基因组序列，将精准复制的范围从单个基因位点扩展到染色体层面。

图1. AE进行基因扩增的模拟图

首先，科研团队在11个细胞系的多个位点进行了验证。在AE复制长度和效率方面，当复制的DNA长度为20 bp至8 Kb时，AE可进行多次复制，形成串联重复序列。当复制长度为1 Mb时，AE的编辑效率最高达73.0%；复制长度为100 Mb（接近人类染色体的平均长度）时，效率达到3.4%。通过原位荧光杂交、核型分析、全基因组测序等实验，可以直接观察到染色体区域的复制。在AE编辑的精准度方面，连接处的二代测序和全长的三代测序数据显示，indels均低于1%。

其次，科研团队利用AE精准修正了绿色荧光蛋白序列和实现miRNA的内源性过表达。同时，科研团队在髓性白血病细胞系K562中建立了α地中海贫血模型，并测试了AE的效果，实现了HBA基因的mRNA水平的提高和 α/γ-珠蛋白比例的上升。这些结果表明AE能够恢复基因表达、扩增miRNA并增加模型细胞系中的α-珠蛋白的表达。

接下来，AE在人源和鼠源干细胞的多个位点均实现了高效精准的短片段和Mb级别编辑，模拟了染色体微重复疾病的基因型，并使用全基因组测序验证了编辑的精准性。这表明AE能够精准构建超大片段复制相关的疾病模型。

最后，该研究对AE的机制进行了初步探究。在被抑制细胞周期的RPE-1细胞中，AE的效率降低。在小鼠原代神经元中，AE只可实现短片段的复制。这说明AE在Mb级别的复制可能依赖于细胞周期。

综上，该研究开发了一种名为“Amplification Editing（AE）”的基因组编辑工具，可实现从短片段到染色体长度的精准复制。该工具的开发可促进基因组疾病模型的建立，推动基因进化和癌症机制相关的研究。

正序生物利用自主创新的碱基编辑技术融合多治疗领域开发了多种创新精准疗法，分别针对遗传疾病、肿瘤、代谢疾病、心血管疾病等布局了近10条管线。正序生物科学创始人殷昊教授科研团队开发的基因组编辑工具AE在基因扩增方面具有重要突破，不仅可以促进基因组疾病模型的建立，还能精准高效地恢复或增加基因表达，将助力正序生物针对更广泛的疾病领域进行创新靶点的开发和精准疗法的研发，为更多患者带来彻底治愈的希望。

Cell论文链接：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.05.056

文章转自“武汉大学医学研究院”微信公众号

关于正序生物

正序生物（CorrectSequence Therapeutics^TM）是一家专注于新型基因编辑技术、处于临床阶段的的生物医药科技公司，致力于利用世界先进的碱基编辑体系，为罹患严重疾病的人们开发突破性精准疗法，造福人类健康。

公司基于以变形式碱基编辑器tBE为代表的自主知识产权碱基编辑系统搭建了融合多治疗领域的新药发现平台，可长期开发和筛选针对多种遗传性疾病或罕见病的有效治疗靶点。所创建的多种精准疗法，在动物体内实现了疾病治疗靶点上的高效的编辑效率和未检出脱靶的安全性。目前，已经针对遗传疾病、肿瘤、代谢疾病、心血管疾病等布局了近10条管线，首条管线CS-101已使多位β-地中海贫血症患者摆脱输血依赖，正处于IND临床试验阶段。

正序生物孵化自上海科技大学，拥有世界一流的创新技术平台和管线研发能力。在中国科学院上海高等研究院和上海细胞和基因产业园拥有先进的研发和生产中心，在北京华贸中心设立有临床注册和运营中心。目前，公司汇聚了数十位来自全球基因治疗技术开发、药物研发、工艺开发与生产、临床开发和质量与合规等领域的优秀生物医药专家，管理团队和科研团队拥有平均十年以上工业界经验，硕士及以上学位比例超过40%，核心技术人员毕业于国内外顶尖名校。

欲了解更多详情，请登录官网：www.correctsequence.com

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