ChiCTR2600129437
尚未开始
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2026-08-04
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建立标准化的胎儿羊水RNA-seq临床检测流程;基于200例正常胎儿的羊水样本构建羊水细胞转录组参考数据库;前瞻性纳入60例胎儿超声异常病例,聚焦与RNA表达异常相关的候选变异,开展转录组分析,最终提升出生缺陷的产前诊断效能。
羊水转录组测序技术提升出生缺陷产前诊断效能的临床研究
羊水转录组测序技术提升出生缺陷产前诊断效能的临床研究
研究目的 1.制定标准化的胎儿羊水RNA-seq临床检测流程 涵盖样本类型和采集→RNA提取→文库构建→生信分析的全流程操作规范。同步比较未经培养羊水与培养后羊水的基因表达谱差异,进而确立以未经培养细胞为转录组分析的主要样本,同时保留培养后细胞作为补充的检测方案,并明确后者适用的临床场景。在流程中,着重优化“湿实验”操作与“生物信息学干分析”的标准化步骤与质控标准,以降低批次间差异。 2.构建正常胎儿羊水细胞转录组参考数据库 通过200例正常胎儿的RNA-seq分析结果,构建包含表达谱基线、关键基因参考区间,以及剪接本底频率的参考数据库。 3.评估RNA-seq技术在提升出生缺陷产前诊断中的效能 通过前瞻性队列中60例异常胎儿的RNA-seq分析结果,采用“靶向策略”对WES检测出的≥10个候选变异进行RNA表达分析;同时探索“独立筛查策略”,寻找有RNA表达证据支持的变异,并回溯关联WES数据,定位相应基因上存在的DNA变异。通过双轨联合分析,解析变异致病机制,评估RNA-seq对产前诊断的效能增益。
队列研究
其它
无
无
北京协和医院中央高水平医院临床 科研专项项目-临床研究项目-青年培优
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60;200
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2026-04-01
2028-03-31
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1.基于200例正常胎儿的羊水样本构建羊水细胞转录组参考数据库,纳入标准:因孕妇高龄、唐筛/NIPT高风险、或本人要求行羊水穿刺。纳入超声结构正常、染色体核型/微阵列芯片结果正常、无已知遗传病家族/妊娠史的胎儿样本。 2.前瞻性纳入60例胎儿超声异常病例,纳入标准:胎儿存在超声异常,且送检产前WES检测。 1.基于200例正常胎儿的羊水样本构建羊水细胞转录组参考数据库,纳入标准:因孕妇高龄、唐筛/NIPT高风险、或本人要求行羊水穿刺。纳入超声结构正常、染色体核型/微阵列芯片结果正常、无已知遗传病家族/妊娠史的胎儿样本。2.前瞻性纳入60例胎儿超声异常病例,纳入标准:胎儿存在超声异常,且送检产前WES检测。;
请登录查看1. 基于200例正常胎儿的羊水样本构建羊水细胞转录组参考数据库,排除标准: (1) 胎儿染色体核型/CMA结果异常; (2) 夫妻双方有已知遗传病家族/妊娠史; (3) 胎儿超声异常; (4) 样本不符合检测条件。 记录相关临床信息(孕周、性别、穿刺指征等)。入组过程中,应确保不同孕周样本数量尽量均衡分布。 2. 前瞻性纳入60例胎儿超声异常病例,排除标准:样本不符合检测条件。严格遵循标准化流程进行羊水RNA-seq检测。详细记录样本特征(穿刺孕周、超声异常表型特征、遗传病家族/妊娠史等)。;
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