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靶向CD19的异体STAR-T细胞治疗难治性系统性红斑狼疮:一项I期临床试验​

CD19 STA I期

嵌合抗原受体(CAR)-T细胞疗法在治疗与B细胞相关的严重自身免疫性疾病方面展现出显著疗效。一系列研究显示,自体抗CD19 CAR-T细胞治疗难治性系统性红斑狼疮(SLE)患者后,获得了显著且持久的临床缓解。但合并狼疮性肾炎(LN)的SLE患者仍然存在重大未满足的需求,现有疗法仅能诱导轻度缓解,仍有相当比例的患者持续存在疾病活动。即便在接受最佳可用治疗的情况下,肾脏病变仍可能继续进展,这一风险凸显了迫切需要更有效的治疗方法。

基于T细胞受体(TCR)复合体的嵌合抗原受体——命名为合成TCR和抗原受体(Synthetic TCR and Antigen Receptor, STAR)。与传统CAR-T细胞相比,可增强抗原敏感性、增殖能力与持久性,同时降低功能失调与毒性。体外研究表明,STAR-T细胞对低新抗原密度的癌细胞表现出更强的杀伤力,并在小鼠模型中实现了更好的肿瘤控制。

临床前数据还提示, STAR结构可能比传统CAR-T细胞具有更强的抗白血病活性。基于这一临床前基础,2025年8月,《Nature Medicine》杂志发表了一篇题为“Allogeneic CD19-targeting T cells for treatment-refractory systemic lupus erythematosus: a phase 1 trial”的文章,文章报道了一项首次人体应用——将异体抗CD19 STAR-T细胞(YTS109)用于治疗严重难治性SLE及LN患者(NCT06379646)。该研究旨在评估其临床疗效与机制效应,探索STAR-T细胞的治疗潜力。

研究结果



试验设计、入组标准和研究终点


文章结果来自一项正在进行的“篮子试验”,评估了异体抗CD19 STAR-T细胞在六种自身免疫性疾病中的应用(图1a),重点关注了首个完成入组的队列,即五例难治性SLE患者。符合条件的患者(年龄18-65岁),具有CD19⁺B细胞,疾病处于活动状态,并且对标准治疗无效。主要研究终点安全性(NCI-CTCAE V5.0)以及第3个月时的SLE应答者指数4(SRI-4)。次要研究终点包括第6个月时的SRI-4、SLE疾病活动评分(DAS)、以及直至第6个月的患者报告结局(包括慢性疾病治疗功能评估-疲劳[FACIT-F]、患者整体评估[PtGA]、狼疮生活质量[QoL]、36项简明健康调查表[SF-36]、五级EQ-5D[EQ-5D-5L])。探索性终点则评估了SLEDAI-2K评分、抗双链DNA抗体(dsDNA)、补体水平以及蛋白尿情况。事后分析通过基因组学、单细胞与空间转录组学、飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF)、蛋白质组学以及肾脏组织病理学等手段,探索了其作用机制。

图1a, STAR-T细胞难治性SLE试验研究流程图



YTS109的制备与特性


YTS109是一种靶向CD19的异体STAR-T细胞产品,它是从健康供体的外周血单核细胞(PBMCs)中制备而来的(图1b)。通过电穿孔方式将包含靶向以下基因的单导RNA(sgRNA)的核糖核蛋白复合物(RNP)导入细胞,利用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑:靶向TRAC基因以破坏引起移植物抗宿主病(GVHD)的TCRαβ复合体的表达;靶向HLA-A、HLA-B和CIITA基因,以尽量减少宿主T细胞的免疫识别,同时避免立即激活自然杀伤(NK)细胞;以及靶向PDCD-1基因,以延长T细胞在体内的存留时间。随后,通过同源重组的方式,利用腺相关病毒(AAV)载体将STAR构建体特异性地整合到TRAC位点。之后,细胞在体外扩增9天,并通过hTCRαβ⁻分选获得最终的YTS109产品(图1b)。

图1b,YTS109的制造过程示意图。


流式细胞术分析(图1c)显示,该细胞产物中TRAC(99.25%)、PD-1(98.82%)、HLA-A(70.9%)、HLA-B(72.6%)和HLA-DP/DQ/DR(70.7%)的阴性细胞比例很高,同时STAR构建体在细胞中的整合率为33.7%,表明该产品具有低免疫原性特征,具备安全临床应用的潜力。

与传统的CAR-T细胞相比,YTS109对低表达CD19的Raji靶细胞表现出显著更强的细胞毒性(图1d),并能有效裂解SLE患者PBMCs中的B细胞(图1e)。在体外混合淋巴细胞反应实验中,与B2M敲除(KO)T细胞相比,NK细胞对YTS109的细胞毒性显著更低(图1f)。此外,与来自同一供体的对照(模拟)T细胞相比,YTS109细胞降低了共培养异体T细胞的增殖水平(图1g),提示其引发宿主抗移植物反应的潜力较低。

全基因组范围的无偏倚双链断裂位点识别方法 —— GUIDE-seq (Genome-wide, Unbiased Identification of Double-stranded Breaks Enabled by Sequencing) 分析共识别出28个潜在的脱靶位点,其中5个位点经扩增子测序验证,包括:DCDC1、ADGRL2、PHACTR1、HLA-E 和 HLA-V (图1h)。在 DCDC1 位点的插入/缺失(indel)率为 3.92%,其余位点的突变率则接近背景水平。染色体分析显示,除目标位点的易位外,未发现其他结构异常。编辑位点的易位频率低于5.77%,与临床试验中所用产品的水平相当(图1i)。这些结果表明,通过TRAC基因敲除联合hTCRαβ⁻分选,可有效预防GVHD,从而显著提高YTS109治疗的安全性。

图1c-i,异体靶向CD19 STAR-T细胞(YTS109)的表征。


患者和治疗


该队列共纳入五例患者(四女一男),年龄介于23-41岁之间, SLE病程为3-30年不等。基线特征(表1)显示,所有患者均存在多器官受累,包括 LN,并频繁出现皮肤、血液系统及肌肉骨骼系统的临床表现。此外,部分患者还存在其他器官受累(如黏膜、心脏、血管等)。所有患者抗核抗体(ANA)检测均为阳性,其中四例患者检出特异性dsDNA抗体,三例患者检出抗Smith抗体。

尽管先前接受过免疫抑制治疗(包括糖皮质激素、环磷酰胺、霉酚酸酯、他克莫司、利妥昔单抗、贝利尤单抗等),但患者疾病活动度仍然较高(SLEDAI-2K评分:16-32;SLE-DAS评分:15.06-42.02;总体BILAG评分:14-34)。这些结果突显了该队列患者疾病的难治性特征。全外显子组测序显示,所有患者均携带致病性基因变异,包括所有病例中的 IRF5 突变,第1例患者的 IFNW1 突变,第4例患者的 C2 突变,进一步揭示了重症SLE的遗传复杂性。

所有患者均在第0天接受YTS109单次输注(剂量为每公斤体重3×10^6个STAR⁺细胞)之前,先进行了淋巴细胞清除预处理:使用氟达拉滨(25-30 mg/m^2/天,第-5天至第-3天)和环磷酰胺(1,000 mg/^2,单次给药或分两天给药)。


表1,5例SLE患者的基线特征

主要研究终点


所有五例患者均在第3个月(M3)达到了主要疗效终点(SRI-4),并将该疗效维持至第6个月(M6)(图2a)。输注治疗后,患者的SELENA-SLEDAI评分和医生整体评估(PGA)评分均出现显著下降。其中四例患者在第2至第4个月期间达到SELENA-SLEDAI评分为零,并将该缓解状态持续至第6个月。M3的BILAG评估显示总体BILAG评分有所改善。所有患者的肾脏评分均从A级改善至B级,其中一例患者改善至C级。患者4在M6时出现轻度疾病复发,这在SELENA-SLEDAI评分和PGA评分中均有所体现。

图2a,患者治疗前后SRI-4应答率的达成情况,以及SELENA-SLEDAI和PGA评分的变化(n = 5)


研究同时达到了主要安全性终点,未发生严重不良事件。两例患者出现了1级细胞因子释放综合征(CRS);未报告任何免疫效应细胞相关神经毒性综合征(ICANS)病例。所有患者均出现短暂性白细胞减少;患者4和患者5出现轻度贫血,但均未出现血小板减少。感染事件包括患者1发生的尿路感染以及患者2的结膜炎。对急性和慢性GVHD症状进行监测,结果显示所有患者均未出现GVHD相关表现(表2)。

表2,YTS109治疗SLE的安全性评价

次要研究终点



YTS109与B细胞在体内的动态变化


为了监测输注后YTS109的情况,研究采用了飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF)进行分析。聚类分析显示,抗CD19 STAR-T细胞在体内发生了扩增,且其表型与患者自身来源的T细胞存在明显差异。与原始细胞产品相比,体内CD8⁺ T细胞的比例有所增加,这主要是由于CD8⁺ STAR-T细胞的扩增更为显著(图2d)。输注后,HLA-A2⁻细胞(即敲除了HLA-A基因的细胞)在CD4⁺和CD8⁺两个亚群中均有所增加(图2e),提示HLA-A敲除可能赋予细胞一定的生存优势。

STAR-T细胞的扩增在输注后的前两周内达到峰值(图2f),与B细胞的快速清除过程相吻合。这种B细胞的减少持续了1至2个月,之后逐渐回升并超过基线水平(图2g),表明在没有持续免疫抑制的情况下,B细胞实现了重建。

尽管B细胞有所恢复,但STAR-T细胞仍持续下降,并未再次出现扩增(图2f)。

四例患者(患者1、2、3和5)显示出疾病活动的快速且持续的缓解,其平均SLE疾病活动评分(SLE-DAS)从基线的31.30降至M3的7.11,进一步降至M6的5.35(图2h)。其中,患者1和患者5达到了完全缓解。患者4则表现为部分且短暂的疗效,其SLE-DAS从基线的15.06降至M3的8.33,但在M6又回升至16.43。患者整体评估(PtGA)评分也在M3时下降,并持续保持低水平至M6。

图2d-h,YTS109与B细胞在体内的动态变化



探索性终点


所有患者均表现出SLEDAI-2K评分的显著下降(图2i),唯一的例外是患者4在M6时出现轻微波动,这与该患者的SLE-DAS评分趋势一致。截至M3,已有两名患者达到低狼疮疾病活动状态以及SLE缓解定义(DORIS)的标准;到M6时,除患者4外,所有患者均已实现低狼疮疾病活动状态。

在抗双链DNA(anti-dsDNA)自身抗体水平方面,三名基线时该抗体水平较高的患者在治疗后14天内迅速下降。其中两名患者实现了抗dsDNA抗体的清除,并在整个监测期内维持在接近零的水平。患者4虽然出现轻微波动,但其抗dsDNA抗体水平始终低于基线值(图2j)。

基线时,患者1、2、4和5均表现出补体C3和C4水平偏低,治疗后所有患者的这两项指标均出现初步改善(图2k)。

大多数患者在输注YTS109后,24小时尿蛋白水平出现显著下降。患者1和患者5在1至2个月内即达到完全肾脏缓解(24小时尿蛋白 < 500 mg),其中患者5在输注后M2就达到了这一目标(图2l)。基线时蛋白尿水平最高的患者2,其尿蛋白水平持续下降,至M6时已接近正常范围。

图2i-l,探索性终点



LN 肾脏病理病变的消退


在两位临床缓解后的知情同意患者中进行了补充活检分析。尽管这两名患者的基线肾脏病理和临床病程有所不同,但在接受YTS109输注后,两者的肾脏组织学检查均显示出肾脏恢复的证据。

患者1在M9时进行的PAS病理检查显示,与基线相比有显著改善,包括肾小球细胞增生减少、基质扩张减轻、免疫复合物沉积减少,以及毛细血管袢结构保存良好,反映了炎症消退和结构修复。

同样,患者5在M6时的病理结果也显示出显著改善,包括系膜细胞增生减少、基质扩张减轻,以及肾小球基底膜上免疫复合物沉积的消退。肾小管结构和间质炎症也出现明显恢复。

值得注意的是,患者1在基线时肾脏中存在明显的CD8⁺ T细胞和CD20⁺ B细胞浸润,而在M9时这些细胞的数量显著减少,提示肾脏炎症有所改善。相比之下,患者5在基线时也存在肾脏B细胞浸润,但随着时间的推移逐渐减少,提示该患者在组织层面上实现了有效的B细胞清除。

通路富集分析(图2p,左)显示,治疗后炎症反应、细胞因子介导的信号传导以及白细胞迁移等相关通路显著下调。定量分析结果(图2p,右)进一步证实,包括近端小管、α-闰细胞以及连接小管上皮细胞在内的多种上皮细胞类型的炎症信号均有所减弱。综合这些结果表明,经过YTS109治疗后,肾脏微环境呈现出炎症程度降低、结构更趋恢复的趋势。

图2p,炎症反应与细胞因子活性均显著降低



输入YTS109后免疫重建


对五例患者在九个时间点(基线、第0天、第14天、M1、M2、M3、M4、M5和M6)采集的PBMCs进行了单细胞RNA测序与B细胞受体(BCR)测序(BCR-seq)。共分析了541,286个细胞,其中包括来自64,676个B细胞的49,738对配对的BCR序列(图3a)。

基于典型标志物进行聚类分析后,共鉴定出16种不同的免疫细胞亚型(图3b)。图3c展示了每种细胞类型在YTS109输注前及输注后各时间点的细胞密度变化情况。图3d则对各细胞群组成比例的变化进行了量化分析,结果显示:基线时原本稀少的B细胞群体在治疗后迅速且显著地被清除,随后在M2之后重新建立起数量更多的B细胞群体(图3d)。

功能通路分析揭示了免疫细胞功能发生了显著变化(图3e)。CD4⁺ T细胞在与免疫抑制相关的通路中呈现上调,包括:单核细胞趋化作用的负调控、Toll样受体4(TLR4)信号通路、B细胞活化以及II型干扰素表达的负调控。CD8⁺ T细胞则表现为单核细胞趋化、TLR4信号通路、IL-17产生以及TCR信号通路的整体下调。还观察到,NK细胞中TLR9信号通路与防御反应的下调,以及在髓系细胞群体中调节性T细胞(Treg)分化的促进、单核细胞趋化的负调控以及T细胞细胞因子产生的抑制。这些发现共同强调了YTS109治疗具有多方面的免疫调节效应。

图3,输入YTS109后的免疫改变



输注YTS109后重建B细胞的特征


将B细胞划分为六个亚群:未成熟B细胞、初始B细胞、未转换与已转换记忆B细胞、双阴性B细胞(DNB)以及浆母细胞/浆细胞(PB/PCs)(图4a-c)。图4d展示了不同B细胞亚群的比例变化情况。

总体而言,基线时B细胞数量非常少,其中很大一部分为经历过抗原刺激的细胞(包括PB/PCs、记忆细胞[未转换与已转换]以及DNB),占比超过50%。治疗后第一个月内,B细胞被深度清除,随后在治疗第二个月后迅速反弹,数量远超基线水平,此时主要由未成熟B细胞和初始B细胞构成(图4c、d)。自第二个月起直至整个监测期,重建后的B细胞水平基本保持稳定,其中较多的未成熟B细胞逐渐分化为初始B细胞,但成熟B细胞群体并未显著增加。在整个监测期内,重建后B细胞群体中具有抗原经历的细胞比例始终低于5%,与基线时超过50%形成鲜明对比(图4c、d)。

图4a-d,输注YTS109后B淋巴细胞组成及克隆性分析。


此外,将基线B细胞与M6重建后B细胞进行比较,共鉴定出732个差异表达基因(校正后P值Padj ≤ 0.05,log2(倍数变化)≥ 1;图4j)。热图展示了基线与M6之间前十个差异表达基因在不同时间点的动态变化,突出显示了与初始和未成熟B细胞相关的基因(如IGHM、IGHD)显著上调,而与B细胞成熟相关的基因(如IGHG1、IGHA1、IGHG2、B2M)显著下调(图4k)。

功能富集分析显示,与B细胞增殖、分化和活化相关的通路显著上调,这主要归因于治疗后重建了更大规模的B细胞群体;而与成熟B细胞分化及B细胞介导的免疫功能相关的通路则显著受到抑制(图4l)。

图4j-l,基线B细胞 vs M6重建后B细胞的基因富集分析。


讨论


综上所述,该研究首次报道了将来源于健康供体、基于STAR技术平台、靶向CD19的细胞治疗产品YTS109应用于合并严重狼疮性肾炎的难治性系统性红斑狼疮患者。研究结果表明,所有患者均实现了有效的B细胞清除,其中两名接受重复肾脏活检的患者还确认了肾脏内B细胞的清除,这与这些患者显著的临床缓解相一致。

YTS109作为一种“即用型”、低免疫原性、无GVHD风险且具有更强体内持久性的细胞治疗产品,凸显了STAR-T细胞工程在自身免疫性疾病治疗中的潜力。值得注意的是,参与这一试验的患者其基线B细胞水平远低于其他采用自体CAR-T产品治疗SLE的临床试验所报告的水平。这一差异主要源于自体细胞产品制备前需暂停使用免疫抑制类抗风湿药物,以便采集外周血单核细胞,而这会使患者面临疾病加重和治疗失败的风险增加。因此,YTS109为患者提供了一种即用型的治疗选择,尤其适用于那些处于危重、快速进展阶段的患者,并且在不依赖持续使用免疫抑制剂的情况下,实现了全面且持久的缓解,同时诱导B细胞群体向初始表型显著转变,比例远高于基线水平。

研究也存在局限性,包括单臂设计、样本量较小(n=5)以及随访时间较短。未来需要开展更大规模、更长周期的研究,以验证疗效的持久性与普适性。

总体而言,该研究凸显了YTS109良好的安全性与疗效特征,表明其在应对合并LN的重症、难治性SLE患者这一迫切未满足的医疗需求方面,具有巨大潜力。然而,为评估该治疗方法的长期效应与潜在持久性,严格的长期监测至关重要。


参考文献:

1.Wang X. et al. Allogeneic CD19-targeting T cells for treatment-refractory systemic lupus erythematosus: a phase 1 trial. Nat Med. 2025 Aug 27.

2.Schett, G. et al. Advancements and challenges in CAR T cell therapy in autoimmune diseases. Nat. Rev. Rheumatol. 20, 531-544 (2024).

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